Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrtm2Q8BGA3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms