Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc50Q810U5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc50Q810U5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc50Q810U5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms