Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SnupnQ80W37 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnupnQ80W37 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnupnQ80W37 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnupnQ80W37 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnupnQ80W37 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnupnQ80W37 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SnupnQ80W37 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SnupnQ80W37 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnupnQ80W37 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnupnQ80W37 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnupnQ80W37 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnupnQ80W37 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnupnQ80W37 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SnupnQ80W37 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SnupnQ80W37 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms