Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM4

Znf579, Zinc finger protein 579, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf579Q80VM4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf579Q80VM4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf579Q80VM4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf579Q80VM4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf579Q80VM4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf579Q80VM4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf579Q80VM4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf579Q80VM4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf579Q80VM4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf579Q80VM4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf579Q80VM4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf579Q80VM4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf579Q80VM4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf579Q80VM4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf579Q80VM4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf579Q80VM4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf579Q80VM4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf579Q80VM4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf579Q80VM4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf579Q80VM4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Znf579Q80VM4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf579Q80VM4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf579Q80VM4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.2 ms