Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SnphQ80U23 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SnphQ80U23 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnphQ80U23 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms