Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdh8Q7TSK3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdh8Q7TSK3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh8Q7TSK3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms