Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dsg1cQ7TSF0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dsg1cQ7TSF0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dsg1cQ7TSF0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dsg1cQ7TSF0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg1cQ7TSF0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg1cQ7TSF0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg1cQ7TSF0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg1cQ7TSF0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg1cQ7TSF0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg1cQ7TSF0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg1cQ7TSF0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg1cQ7TSF0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg1cQ7TSF0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Dsg1cQ7TSF0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dsg1cQ7TSF0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dsg1cQ7TSF0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg1cQ7TSF0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms