Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf18Q7TS55 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf18Q7TS55 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf18Q7TS55 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms