Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim17Q7TPM3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim17Q7TPM3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim17Q7TPM3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim17Q7TPM3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim17Q7TPM3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim17Q7TPM3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim17Q7TPM3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim17Q7TPM3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim17Q7TPM3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim17Q7TPM3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim17Q7TPM3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim17Q7TPM3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim17Q7TPM3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim17Q7TPM3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim17Q7TPM3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim17Q7TPM3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim17Q7TPM3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim17Q7TPM3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim17Q7TPM3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim17Q7TPM3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim17Q7TPM3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim17Q7TPM3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim17Q7TPM3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim17Q7TPM3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim17Q7TPM3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim17Q7TPM3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim17Q7TPM3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim17Q7TPM3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim17Q7TPM3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim17Q7TPM3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim17Q7TPM3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim17Q7TPM3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim17Q7TPM3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms