Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SynmQ70IV5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SynmQ70IV5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SynmQ70IV5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SynmQ70IV5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SynmQ70IV5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SynmQ70IV5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
SynmQ70IV5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SynmQ70IV5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
SynmQ70IV5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SynmQ70IV5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SynmQ70IV5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SynmQ70IV5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SynmQ70IV5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SynmQ70IV5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SynmQ70IV5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SynmQ70IV5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
SynmQ70IV5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SynmQ70IV5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SynmQ70IV5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SynmQ70IV5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SynmQ70IV5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SynmQ70IV5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SynmQ70IV5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SynmQ70IV5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SynmQ70IV5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
SynmQ70IV5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SynmQ70IV5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SynmQ70IV5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
SynmQ70IV5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
SynmQ70IV5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SynmQ70IV5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SynmQ70IV5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SynmQ70IV5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
SynmQ70IV5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SynmQ70IV5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SynmQ70IV5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SynmQ70IV5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SynmQ70IV5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SynmQ70IV5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SynmQ70IV5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SynmQ70IV5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SynmQ70IV5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
SynmQ70IV5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SynmQ70IV5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SynmQ70IV5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SynmQ70IV5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SynmQ70IV5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SynmQ70IV5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SynmQ70IV5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SynmQ70IV5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SynmQ70IV5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SynmQ70IV5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SynmQ70IV5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SynmQ70IV5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
SynmQ70IV5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SynmQ70IV5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SynmQ70IV5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SynmQ70IV5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SynmQ70IV5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SynmQ70IV5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SynmQ70IV5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SynmQ70IV5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SynmQ70IV5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SynmQ70IV5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
SynmQ70IV5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SynmQ70IV5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
SynmQ70IV5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SynmQ70IV5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SynmQ70IV5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SynmQ70IV5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SynmQ70IV5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SynmQ70IV5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SynmQ70IV5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SynmQ70IV5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SynmQ70IV5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SynmQ70IV5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SynmQ70IV5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SynmQ70IV5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SynmQ70IV5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SynmQ70IV5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SynmQ70IV5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
SynmQ70IV5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SynmQ70IV5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SynmQ70IV5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SynmQ70IV5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SynmQ70IV5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SynmQ70IV5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SynmQ70IV5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SynmQ70IV5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SynmQ70IV5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SynmQ70IV5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
SynmQ70IV5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SynmQ70IV5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SynmQ70IV5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SynmQ70IV5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SynmQ70IV5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SynmQ70IV5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SynmQ70IV5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SynmQ70IV5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.2 ms