Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nemp1Q6ZQE4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nemp1Q6ZQE4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nemp1Q6ZQE4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nemp1Q6ZQE4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nemp1Q6ZQE4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nemp1Q6ZQE4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nemp1Q6ZQE4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nemp1Q6ZQE4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nemp1Q6ZQE4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nemp1Q6ZQE4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nemp1Q6ZQE4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nemp1Q6ZQE4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nemp1Q6ZQE4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nemp1Q6ZQE4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nemp1Q6ZQE4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nemp1Q6ZQE4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nemp1Q6ZQE4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nemp1Q6ZQE4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nemp1Q6ZQE4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nemp1Q6ZQE4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nemp1Q6ZQE4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nemp1Q6ZQE4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203.8 ms