Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp34Q6ZQ93 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp34Q6ZQ93 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp34Q6ZQ93 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp34Q6ZQ93 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp34Q6ZQ93 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp34Q6ZQ93 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp34Q6ZQ93 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp34Q6ZQ93 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp34Q6ZQ93 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp34Q6ZQ93 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp34Q6ZQ93 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp34Q6ZQ93 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp34Q6ZQ93 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp34Q6ZQ93 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp34Q6ZQ93 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp34Q6ZQ93 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp34Q6ZQ93 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp34Q6ZQ93 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp34Q6ZQ93 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp34Q6ZQ93 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp34Q6ZQ93 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp34Q6ZQ93 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp34Q6ZQ93 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp34Q6ZQ93 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp34Q6ZQ93 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp34Q6ZQ93 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp34Q6ZQ93 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp34Q6ZQ93 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp34Q6ZQ93 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp34Q6ZQ93 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp34Q6ZQ93 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp34Q6ZQ93 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp34Q6ZQ93 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp34Q6ZQ93 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp34Q6ZQ93 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp34Q6ZQ93 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp34Q6ZQ93 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp34Q6ZQ93 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp34Q6ZQ93 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp34Q6ZQ93 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms