Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc44a1Q6X893 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Slc44a1Q6X893 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slc44a1Q6X893 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms