Protein–RNA interactions for Protein: Q6VNB8

Wdfy3, WD repeat and FYVE domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 3,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdfy3Q6VNB8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Wdfy3Q6VNB8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdfy3Q6VNB8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdfy3Q6VNB8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdfy3Q6VNB8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdfy3Q6VNB8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdfy3Q6VNB8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Wdfy3Q6VNB8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Wdfy3Q6VNB8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Wdfy3Q6VNB8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdfy3Q6VNB8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdfy3Q6VNB8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Wdfy3Q6VNB8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdfy3Q6VNB8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdfy3Q6VNB8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdfy3Q6VNB8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdfy3Q6VNB8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdfy3Q6VNB8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdfy3Q6VNB8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdfy3Q6VNB8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdfy3Q6VNB8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdfy3Q6VNB8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdfy3Q6VNB8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms