Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc88cQ6VGS5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc88cQ6VGS5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc88cQ6VGS5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc88cQ6VGS5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc88cQ6VGS5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms