Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcaf3Q6QR59 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcaf3Q6QR59 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcaf3Q6QR59 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcaf3Q6QR59 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcaf3Q6QR59 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcaf3Q6QR59 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcaf3Q6QR59 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcaf3Q6QR59 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcaf3Q6QR59 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcaf3Q6QR59 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcaf3Q6QR59 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcaf3Q6QR59 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcaf3Q6QR59 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcaf3Q6QR59 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcaf3Q6QR59 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcaf3Q6QR59 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcaf3Q6QR59 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcaf3Q6QR59 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcaf3Q6QR59 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcaf3Q6QR59 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcaf3Q6QR59 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcaf3Q6QR59 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcaf3Q6QR59 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcaf3Q6QR59 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcaf3Q6QR59 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcaf3Q6QR59 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcaf3Q6QR59 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcaf3Q6QR59 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcaf3Q6QR59 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcaf3Q6QR59 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcaf3Q6QR59 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcaf3Q6QR59 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcaf3Q6QR59 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcaf3Q6QR59 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcaf3Q6QR59 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcaf3Q6QR59 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcaf3Q6QR59 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcaf3Q6QR59 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcaf3Q6QR59 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcaf3Q6QR59 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tcaf3Q6QR59 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcaf3Q6QR59 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tcaf3Q6QR59 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcaf3Q6QR59 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcaf3Q6QR59 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcaf3Q6QR59 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcaf3Q6QR59 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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Tcaf3Q6QR59 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcaf3Q6QR59 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcaf3Q6QR59 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcaf3Q6QR59 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcaf3Q6QR59 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcaf3Q6QR59 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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Tcaf3Q6QR59 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcaf3Q6QR59 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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Tcaf3Q6QR59 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tcaf3Q6QR59 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcaf3Q6QR59 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcaf3Q6QR59 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcaf3Q6QR59 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcaf3Q6QR59 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcaf3Q6QR59 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
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Tcaf3Q6QR59 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tcaf3Q6QR59 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tcaf3Q6QR59 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tcaf3Q6QR59 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tcaf3Q6QR59 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tcaf3Q6QR59 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tcaf3Q6QR59 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tcaf3Q6QR59 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tcaf3Q6QR59 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tcaf3Q6QR59 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tcaf3Q6QR59 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tcaf3Q6QR59 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcaf3Q6QR59 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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