Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrt3Q6PE13 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prrt3Q6PE13 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prrt3Q6PE13 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prrt3Q6PE13 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.9 ms