Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smchd1Q6P5D8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smchd1Q6P5D8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smchd1Q6P5D8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smchd1Q6P5D8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Smchd1Q6P5D8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smchd1Q6P5D8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smchd1Q6P5D8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smchd1Q6P5D8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smchd1Q6P5D8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smchd1Q6P5D8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smchd1Q6P5D8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smchd1Q6P5D8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smchd1Q6P5D8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smchd1Q6P5D8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smchd1Q6P5D8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smchd1Q6P5D8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Smchd1Q6P5D8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smchd1Q6P5D8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smchd1Q6P5D8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smchd1Q6P5D8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smchd1Q6P5D8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Smchd1Q6P5D8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smchd1Q6P5D8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smchd1Q6P5D8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smchd1Q6P5D8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smchd1Q6P5D8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smchd1Q6P5D8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smchd1Q6P5D8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Smchd1Q6P5D8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smchd1Q6P5D8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smchd1Q6P5D8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smchd1Q6P5D8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smchd1Q6P5D8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smchd1Q6P5D8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smchd1Q6P5D8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smchd1Q6P5D8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
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