Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Asic1Q6NXK8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Asic1Q6NXK8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Asic1Q6NXK8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Asic1Q6NXK8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Asic1Q6NXK8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Asic1Q6NXK8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Asic1Q6NXK8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Asic1Q6NXK8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Asic1Q6NXK8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Asic1Q6NXK8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Asic1Q6NXK8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Asic1Q6NXK8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Asic1Q6NXK8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Asic1Q6NXK8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Asic1Q6NXK8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Asic1Q6NXK8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Asic1Q6NXK8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Asic1Q6NXK8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Asic1Q6NXK8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Asic1Q6NXK8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Asic1Q6NXK8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Asic1Q6NXK8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Asic1Q6NXK8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Asic1Q6NXK8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Asic1Q6NXK8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Asic1Q6NXK8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Asic1Q6NXK8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Asic1Q6NXK8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Asic1Q6NXK8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Asic1Q6NXK8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Asic1Q6NXK8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Asic1Q6NXK8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Asic1Q6NXK8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Asic1Q6NXK8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Asic1Q6NXK8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Asic1Q6NXK8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Asic1Q6NXK8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Asic1Q6NXK8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Asic1Q6NXK8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Asic1Q6NXK8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Asic1Q6NXK8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Asic1Q6NXK8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Asic1Q6NXK8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms