Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg16l2Q6KAU8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg16l2Q6KAU8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg16l2Q6KAU8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms