Protein–RNA interactions for Protein: Q6DR99

Nrg1, Neuregulin 1, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrg1Q6DR99 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nrg1Q6DR99 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nrg1Q6DR99 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrg1Q6DR99 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrg1Q6DR99 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrg1Q6DR99 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrg1Q6DR99 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrg1Q6DR99 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrg1Q6DR99 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrg1Q6DR99 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrg1Q6DR99 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrg1Q6DR99 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrg1Q6DR99 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nrg1Q6DR99 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrg1Q6DR99 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrg1Q6DR99 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrg1Q6DR99 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrg1Q6DR99 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrg1Q6DR99 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrg1Q6DR99 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrg1Q6DR99 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrg1Q6DR99 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrg1Q6DR99 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrg1Q6DR99 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrg1Q6DR99 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrg1Q6DR99 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrg1Q6DR99 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrg1Q6DR99 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrg1Q6DR99 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrg1Q6DR99 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrg1Q6DR99 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrg1Q6DR99 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nrg1Q6DR99 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nrg1Q6DR99 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nrg1Q6DR99 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrg1Q6DR99 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrg1Q6DR99 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrg1Q6DR99 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrg1Q6DR99 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrg1Q6DR99 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrg1Q6DR99 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrg1Q6DR99 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nrg1Q6DR99 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nrg1Q6DR99 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nrg1Q6DR99 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrg1Q6DR99 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrg1Q6DR99 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrg1Q6DR99 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrg1Q6DR99 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrg1Q6DR99 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrg1Q6DR99 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms