Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tfe3Q64092 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tfe3Q64092 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tfe3Q64092 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tfe3Q64092 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tfe3Q64092 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tfe3Q64092 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tfe3Q64092 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms