Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup62Q63850 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup62Q63850 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup62Q63850 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup62Q63850 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup62Q63850 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup62Q63850 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup62Q63850 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup62Q63850 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup62Q63850 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup62Q63850 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup62Q63850 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup62Q63850 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup62Q63850 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup62Q63850 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup62Q63850 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup62Q63850 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup62Q63850 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup62Q63850 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nup62Q63850 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup62Q63850 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup62Q63850 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup62Q63850 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup62Q63850 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup62Q63850 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup62Q63850 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup62Q63850 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nup62Q63850 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms