Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CochQ62507 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CochQ62507 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CochQ62507 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CochQ62507 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CochQ62507 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CochQ62507 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CochQ62507 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CochQ62507 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CochQ62507 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CochQ62507 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CochQ62507 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CochQ62507 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CochQ62507 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CochQ62507 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CochQ62507 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CochQ62507 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CochQ62507 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CochQ62507 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CochQ62507 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CochQ62507 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CochQ62507 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CochQ62507 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CochQ62507 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CochQ62507 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CochQ62507 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CochQ62507 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CochQ62507 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CochQ62507 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CochQ62507 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CochQ62507 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CochQ62507 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CochQ62507 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CochQ62507 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CochQ62507 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CochQ62507 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CochQ62507 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CochQ62507 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CochQ62507 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CochQ62507 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CochQ62507 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CochQ62507 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CochQ62507 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CochQ62507 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CochQ62507 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CochQ62507 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CochQ62507 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CochQ62507 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CochQ62507 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CochQ62507 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CochQ62507 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CochQ62507 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CochQ62507 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CochQ62507 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CochQ62507 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CochQ62507 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CochQ62507 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CochQ62507 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CochQ62507 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CochQ62507 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CochQ62507 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CochQ62507 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CochQ62507 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CochQ62507 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CochQ62507 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CochQ62507 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CochQ62507 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CochQ62507 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CochQ62507 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CochQ62507 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CochQ62507 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CochQ62507 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CochQ62507 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CochQ62507 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CochQ62507 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CochQ62507 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CochQ62507 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CochQ62507 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CochQ62507 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CochQ62507 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CochQ62507 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CochQ62507 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CochQ62507 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CochQ62507 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CochQ62507 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CochQ62507 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CochQ62507 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CochQ62507 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CochQ62507 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CochQ62507 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CochQ62507 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CochQ62507 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CochQ62507 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CochQ62507 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CochQ62507 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CochQ62507 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CochQ62507 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CochQ62507 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CochQ62507 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CochQ62507 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.1 ms