Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AtmQ62388 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AtmQ62388 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AtmQ62388 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AtmQ62388 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AtmQ62388 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AtmQ62388 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AtmQ62388 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AtmQ62388 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AtmQ62388 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AtmQ62388 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtmQ62388 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtmQ62388 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AtmQ62388 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AtmQ62388 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AtmQ62388 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AtmQ62388 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtmQ62388 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtmQ62388 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtmQ62388 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtmQ62388 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtmQ62388 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtmQ62388 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtmQ62388 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtmQ62388 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtmQ62388 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtmQ62388 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtmQ62388 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AtmQ62388 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtmQ62388 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtmQ62388 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtmQ62388 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtmQ62388 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtmQ62388 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtmQ62388 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AtmQ62388 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AtmQ62388 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AtmQ62388 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtmQ62388 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AtmQ62388 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AtmQ62388 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AtmQ62388 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1.11
AtmQ62388 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AtmQ62388 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AtmQ62388 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AtmQ62388 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AtmQ62388 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AtmQ62388 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AtmQ62388 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AtmQ62388 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AtmQ62388 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 534.3 ms