Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SnrpcQ62241 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SnrpcQ62241 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SnrpcQ62241 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1505.7 ms