Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcbp2Q61990 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcbp2Q61990 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pcbp2Q61990 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcbp2Q61990 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms