Protein–RNA interactions for Protein: Q61830

Mrc1, Macrophage mannose receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrc1Q61830 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mrc1Q61830 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mrc1Q61830 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mrc1Q61830 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mrc1Q61830 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mrc1Q61830 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mrc1Q61830 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Mrc1Q61830 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mrc1Q61830 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mrc1Q61830 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mrc1Q61830 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mrc1Q61830 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mrc1Q61830 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mrc1Q61830 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mrc1Q61830 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mrc1Q61830 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mrc1Q61830 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mrc1Q61830 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mrc1Q61830 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mrc1Q61830 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Mrc1Q61830 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mrc1Q61830 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mrc1Q61830 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mrc1Q61830 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mrc1Q61830 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mrc1Q61830 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mrc1Q61830 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mrc1Q61830 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mrc1Q61830 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mrc1Q61830 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mrc1Q61830 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mrc1Q61830 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mrc1Q61830 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mrc1Q61830 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mrc1Q61830 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Mrc1Q61830 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mrc1Q61830 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mrc1Q61830 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mrc1Q61830 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mrc1Q61830 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mrc1Q61830 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mrc1Q61830 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mrc1Q61830 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mrc1Q61830 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mrc1Q61830 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mrc1Q61830 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mrc1Q61830 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mrc1Q61830 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mrc1Q61830 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mrc1Q61830 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mrc1Q61830 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Mrc1Q61830 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms