Protein–RNA interactions for Protein: Q61762

Kcna5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna5Q61762 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna5Q61762 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcna5Q61762 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kcna5Q61762 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna5Q61762 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna5Q61762 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna5Q61762 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna5Q61762 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna5Q61762 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna5Q61762 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna5Q61762 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcna5Q61762 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna5Q61762 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna5Q61762 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna5Q61762 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna5Q61762 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcna5Q61762 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcna5Q61762 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcna5Q61762 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms