Protein–RNA interactions for Protein: Q61711

Ibsp, Bone sialoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IbspQ61711 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IbspQ61711 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IbspQ61711 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IbspQ61711 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IbspQ61711 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IbspQ61711 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IbspQ61711 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IbspQ61711 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IbspQ61711 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IbspQ61711 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IbspQ61711 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IbspQ61711 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IbspQ61711 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IbspQ61711 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.8 ms