Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc1Q61056 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Trpc1Q61056 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpc1Q61056 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Trpc1Q61056 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpc1Q61056 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc1Q61056 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Trpc1Q61056 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc1Q61056 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc1Q61056 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc1Q61056 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc1Q61056 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc1Q61056 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc1Q61056 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc1Q61056 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc1Q61056 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc1Q61056 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc1Q61056 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc1Q61056 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpc1Q61056 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpc1Q61056 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpc1Q61056 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc1Q61056 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc1Q61056 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc1Q61056 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc1Q61056 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc1Q61056 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc1Q61056 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc1Q61056 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc1Q61056 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc1Q61056 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc1Q61056 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Trpc1Q61056 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc1Q61056 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc1Q61056 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc1Q61056 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Trpc1Q61056 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc1Q61056 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Trpc1Q61056 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Trpc1Q61056 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc1Q61056 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Trpc1Q61056 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc1Q61056 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc1Q61056 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Trpc1Q61056 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Trpc1Q61056 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc1Q61056 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc1Q61056 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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