Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Traf3Q60803 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf3Q60803 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf3Q60803 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Traf3Q60803 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf3Q60803 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms