Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prdm1Q60636 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Prdm1Q60636 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prdm1Q60636 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prdm1Q60636 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prdm1Q60636 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prdm1Q60636 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prdm1Q60636 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prdm1Q60636 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prdm1Q60636 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Prdm1Q60636 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prdm1Q60636 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Prdm1Q60636 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prdm1Q60636 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prdm1Q60636 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prdm1Q60636 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prdm1Q60636 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prdm1Q60636 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prdm1Q60636 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Prdm1Q60636 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prdm1Q60636 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms