Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arcn1Q5XJY5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arcn1Q5XJY5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arcn1Q5XJY5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arcn1Q5XJY5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arcn1Q5XJY5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arcn1Q5XJY5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arcn1Q5XJY5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Arcn1Q5XJY5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Arcn1Q5XJY5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Arcn1Q5XJY5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Arcn1Q5XJY5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Arcn1Q5XJY5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arcn1Q5XJY5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arcn1Q5XJY5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arcn1Q5XJY5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arcn1Q5XJY5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Arcn1Q5XJY5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Arcn1Q5XJY5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arcn1Q5XJY5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arcn1Q5XJY5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arcn1Q5XJY5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arcn1Q5XJY5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms