Protein–RNA interactions for Protein: Q5U406

Zfp78, Zinc finger protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp78Q5U406 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp78Q5U406 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp78Q5U406 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp78Q5U406 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp78Q5U406 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp78Q5U406 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Zfp78Q5U406 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp78Q5U406 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp78Q5U406 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp78Q5U406 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp78Q5U406 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp78Q5U406 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp78Q5U406 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp78Q5U406 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp78Q5U406 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp78Q5U406 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp78Q5U406 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp78Q5U406 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp78Q5U406 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp78Q5U406 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp78Q5U406 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp78Q5U406 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp78Q5U406 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp78Q5U406 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp78Q5U406 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp78Q5U406 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp78Q5U406 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp78Q5U406 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms