Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71bQ5STT6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71bQ5STT6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71bQ5STT6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71bQ5STT6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71bQ5STT6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71bQ5STT6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71bQ5STT6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71bQ5STT6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71bQ5STT6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71bQ5STT6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71bQ5STT6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71bQ5STT6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71bQ5STT6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71bQ5STT6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71bQ5STT6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71bQ5STT6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71bQ5STT6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71bQ5STT6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71bQ5STT6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam71bQ5STT6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71bQ5STT6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam71bQ5STT6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam71bQ5STT6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms