Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRT8

Ccnjl, Cyclin-J-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnjlQ5SRT8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CcnjlQ5SRT8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CcnjlQ5SRT8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CcnjlQ5SRT8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcnjlQ5SRT8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CcnjlQ5SRT8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CcnjlQ5SRT8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CcnjlQ5SRT8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcnjlQ5SRT8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcnjlQ5SRT8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcnjlQ5SRT8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcnjlQ5SRT8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcnjlQ5SRT8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnjlQ5SRT8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnjlQ5SRT8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnjlQ5SRT8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnjlQ5SRT8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnjlQ5SRT8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnjlQ5SRT8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CcnjlQ5SRT8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms