Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trdv2-2Q5R1A4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms