Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clhc1Q5M6W3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clhc1Q5M6W3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clhc1Q5M6W3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms