Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Afap1l2Q5DTU0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afap1l2Q5DTU0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Afap1l2Q5DTU0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Afap1l2Q5DTU0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms