Protein–RNA interactions for Protein: Q4LFA9

Sema3g, Semaphorin-3G, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3gQ4LFA9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3gQ4LFA9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3gQ4LFA9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3gQ4LFA9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3gQ4LFA9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3gQ4LFA9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3gQ4LFA9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3gQ4LFA9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3gQ4LFA9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3gQ4LFA9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3gQ4LFA9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3gQ4LFA9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3gQ4LFA9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3gQ4LFA9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3gQ4LFA9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3gQ4LFA9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3gQ4LFA9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3gQ4LFA9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229.4 ms