Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Shank3Q4ACU6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Shank3Q4ACU6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Shank3Q4ACU6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Shank3Q4ACU6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Shank3Q4ACU6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Shank3Q4ACU6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Shank3Q4ACU6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Shank3Q4ACU6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Shank3Q4ACU6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Shank3Q4ACU6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Shank3Q4ACU6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Shank3Q4ACU6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Shank3Q4ACU6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Shank3Q4ACU6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Shank3Q4ACU6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Shank3Q4ACU6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Shank3Q4ACU6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Shank3Q4ACU6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Shank3Q4ACU6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Shank3Q4ACU6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Shank3Q4ACU6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Shank3Q4ACU6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Shank3Q4ACU6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Shank3Q4ACU6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Shank3Q4ACU6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Shank3Q4ACU6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Shank3Q4ACU6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Shank3Q4ACU6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Shank3Q4ACU6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Shank3Q4ACU6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Shank3Q4ACU6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Shank3Q4ACU6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Shank3Q4ACU6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Shank3Q4ACU6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Shank3Q4ACU6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Shank3Q4ACU6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Shank3Q4ACU6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Shank3Q4ACU6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Shank3Q4ACU6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Shank3Q4ACU6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Shank3Q4ACU6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Shank3Q4ACU6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Shank3Q4ACU6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Shank3Q4ACU6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Shank3Q4ACU6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Shank3Q4ACU6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Shank3Q4ACU6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Shank3Q4ACU6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Shank3Q4ACU6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Shank3Q4ACU6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Shank3Q4ACU6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Shank3Q4ACU6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Shank3Q4ACU6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Shank3Q4ACU6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Shank3Q4ACU6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Shank3Q4ACU6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Shank3Q4ACU6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Shank3Q4ACU6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Shank3Q4ACU6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Shank3Q4ACU6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Shank3Q4ACU6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Shank3Q4ACU6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Shank3Q4ACU6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Shank3Q4ACU6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Shank3Q4ACU6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Shank3Q4ACU6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Shank3Q4ACU6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Shank3Q4ACU6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Shank3Q4ACU6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Shank3Q4ACU6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Shank3Q4ACU6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Shank3Q4ACU6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Shank3Q4ACU6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Shank3Q4ACU6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Shank3Q4ACU6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Shank3Q4ACU6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms