Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga1Q3V3R4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itga1Q3V3R4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga1Q3V3R4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga1Q3V3R4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga1Q3V3R4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga1Q3V3R4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga1Q3V3R4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga1Q3V3R4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga1Q3V3R4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga1Q3V3R4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga1Q3V3R4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga1Q3V3R4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga1Q3V3R4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga1Q3V3R4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga1Q3V3R4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga1Q3V3R4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga1Q3V3R4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga1Q3V3R4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga1Q3V3R4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga1Q3V3R4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga1Q3V3R4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga1Q3V3R4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga1Q3V3R4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga1Q3V3R4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga1Q3V3R4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga1Q3V3R4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga1Q3V3R4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga1Q3V3R4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga1Q3V3R4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga1Q3V3R4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga1Q3V3R4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga1Q3V3R4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga1Q3V3R4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga1Q3V3R4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga1Q3V3R4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga1Q3V3R4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itga1Q3V3R4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms