Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0W9

4930432M17Rik, RIKEN cDNA 4930432M17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930432M17RikQ3V0W9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930432M17RikQ3V0W9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930432M17RikQ3V0W9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930432M17RikQ3V0W9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms