Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Garnl3Q3V0G7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Garnl3Q3V0G7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Garnl3Q3V0G7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Garnl3Q3V0G7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms