Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnaaf3Q3UYV8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dnaaf3Q3UYV8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaaf3Q3UYV8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnaaf3Q3UYV8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnaaf3Q3UYV8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms