Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
H2-Eb2Q3UUV9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Eb2Q3UUV9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Eb2Q3UUV9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms