Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Skap1Q3UUV5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Skap1Q3UUV5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Skap1Q3UUV5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Skap1Q3UUV5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Skap1Q3UUV5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Skap1Q3UUV5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Skap1Q3UUV5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Skap1Q3UUV5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Skap1Q3UUV5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Skap1Q3UUV5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Skap1Q3UUV5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Skap1Q3UUV5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Skap1Q3UUV5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Skap1Q3UUV5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Skap1Q3UUV5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Skap1Q3UUV5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Skap1Q3UUV5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms