Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm29609Q3UU56 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm29609Q3UU56 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm29609Q3UU56 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm29609Q3UU56 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm29609Q3UU56 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm29609Q3UU56 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm29609Q3UU56 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm29609Q3UU56 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm29609Q3UU56 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm29609Q3UU56 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm29609Q3UU56 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm29609Q3UU56 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm29609Q3UU56 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm29609Q3UU56 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm29609Q3UU56 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm29609Q3UU56 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm29609Q3UU56 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm29609Q3UU56 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm29609Q3UU56 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm29609Q3UU56 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms