Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3USZ8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3USZ8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3USZ8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3USZ8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q3USZ8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3USZ8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3USZ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3USZ8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3USZ8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3USZ8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q3USZ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q3USZ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3USZ8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3USZ8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3USZ8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3USZ8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3USZ8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3USZ8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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